La actividad de investigación se puede clasificar en pura y aplicada. Con el término Pura se quiere significar las investigaciones básicas, que generan nuevos conocimiento, reformulan teoría, resuelven conjeturas y contribuyen al avance de la ciencia Matemática. Con el término de Aplicada se denominan las investigaciones en Matemática tendientes a desarrollar teorías y conceptos matemáticos que sirvan como herramientas para avanzar en el conocimiento de otras ciencias.

En la actualidad el NUCOMPA consta de cinco Proyectos de investigación acreditados por la Secretaría de Ciencia, Arte y Tecnología :